現(xiàn)行物流成本管理存在許多問題，計(jì)算方法上沒有切實(shí)掌握物流成本，尤其是沒有切實(shí)掌握公司內(nèi)部的物流費(fèi)用。企業(yè)內(nèi)部對于物流成本不甚了解，對于物流成本是什么也十分模糊。弄不清物流成本與制造成本，物流成本與促銷費(fèi)用的關(guān)系。物流成本中混有物流部門根本無法控制的成本。企業(yè)不同，物流成本的計(jì)算標(biāo)準(zhǔn)也不同，企業(yè)內(nèi)部計(jì)算物流成本的標(biāo)準(zhǔn)時(shí)常改變，每一年度都變動(dòng)的企業(yè)較多。另外，計(jì)算物流成本的目的也存在很多問題，比如計(jì)算物流成本的目的不明確，有的只是單純地想了解物流費(fèi)用，還沒有達(dá)到利用物流成本的階段，有的物流負(fù)責(zé)部門花費(fèi)很大精力計(jì)算物流成本，但也只是計(jì)算一下物流成本多少而已。總的來說，物流成本管理還沒有超出財(cái)務(wù)會(huì)計(jì)的范圍。分析降低現(xiàn)行物流成本方面存在的問題主要有以下幾點(diǎn):第一，物流部門向高層管理人員報(bào)告的物流成本，只不過是“冰山一角”。而沒有向他們生產(chǎn)、銷售部門提供有關(guān)物流成本的確切的有價(jià)值的資料。降低物流成本只是靠物流部門去解決，而沒有與生產(chǎn)和銷售部門共同研究解決。第二，大多企業(yè)沒有建立起多批次、小批量物流系統(tǒng)，只是企圖在過去物流系統(tǒng)的基礎(chǔ)上降低物流成本，沒有注意到機(jī)構(gòu)之間的壁壘，如支店之間的壁壘已成為降低成本的障礙，有的即使注意到了，也沒有認(rèn)真解決。第三，沒有正規(guī)的負(fù)責(zé)物流會(huì)計(jì)的專門人員和機(jī)構(gòu)，有的公司把降低物流成本的工作完全委之他人（物流專業(yè)人員或銷售、生產(chǎn)部門），而且各個(gè)企業(yè)計(jì)算物流成本的范圍本不相同，可是有的企業(yè)卻偏偏要做對比，并因此時(shí)喜時(shí)憂。

針對當(dāng)前物流成本管理存在的問題，大多物流公司由于實(shí)行多批次、小批量配送和適時(shí)配送，也由于收貨單位過多和過高的服務(wù)要求物流服務(wù)水平越來越高，導(dǎo)致運(yùn)費(fèi)上升；又由于商品品種增多，壽命縮短，必然出現(xiàn)庫存增加，或時(shí)多時(shí)少，由此導(dǎo)致庫存費(fèi)用上升；由于缺乏勞動(dòng)力導(dǎo)致人頭費(fèi)用增多；由于地價(jià)上漲導(dǎo)致物流中心投資費(fèi)用增加；由于道路擁擠導(dǎo)致運(yùn)輸效率下降。凡此種種都在影響著物流成本。因此在這種情況下企業(yè)降低物流成本已成為當(dāng)務(wù)之急。為降低物流成本，首先必須了解物流的實(shí)際情況，然后對物流系統(tǒng)進(jìn)行分析，發(fā)現(xiàn)問題加以改進(jìn)，最后建立起一個(gè)可行的新的物流系統(tǒng)。

正確計(jì)算物流成本是有效降低物流成本的基礎(chǔ)，目前的物流成本核算方式主要有按支付形態(tài)計(jì)算、按功能計(jì)算和按適用對象計(jì)算等三種。按支付形態(tài)計(jì)算是把物流成本分別按運(yùn)費(fèi)、保管費(fèi)、包裝材料費(fèi)、企業(yè)內(nèi)部配送費(fèi)、人事費(fèi)、物流管理費(fèi)、物流利息等支付形態(tài)記賬。從中可以了解物流成本總額，也可以了解什么經(jīng)費(fèi)項(xiàng)目花費(fèi)最多。這對認(rèn)識(shí)物流成本合理化的重要性以及考慮在物流成本管理上應(yīng)以什么為重點(diǎn)，十分有效。按功能計(jì)算是指分別按包裝、配送、保管、搬運(yùn)、信息、物流管理等功能計(jì)算物流費(fèi)用。從這種方法可以看出哪種功能更耗費(fèi)成本，比按形態(tài)計(jì)算成本的方法能更進(jìn)一步找出實(shí)現(xiàn)物流合理化的癥結(jié)。而且可以計(jì)算出標(biāo)準(zhǔn)物流成本（單位個(gè)數(shù)、重量、容器的成本），進(jìn)行作業(yè)管理，設(shè)定合理化目標(biāo)。按功能計(jì)算物流成本，可以從功能的角度掌握；按形態(tài)計(jì)算出來的物流成本，在將物流部門費(fèi)用按不同的功能詳細(xì)劃分時(shí)，其分配基準(zhǔn)比例由于行業(yè)和企業(yè)情況的不同而不同。因此根據(jù)本企業(yè)的實(shí)際情況找出分配基準(zhǔn)是很重要的。還可以按單位（配送一件或挑選一個(gè)）計(jì)算功能物流成本。再就各個(gè)功能物流成本的構(gòu)成比例或金額與上一年度進(jìn)行比較，弄清增減原因，研究指定整改方案。按適用對象計(jì)算物流成本，可以分析出物流成本都用在哪一種對象上。如可以分別把商品、地區(qū)、顧客、或營業(yè)單位作為適用對象來進(jìn)行計(jì)算。按支店或營業(yè)所計(jì)算物流成本，就是要算出各營業(yè)單位物流成本與銷售金額或毛收入的對比，用來了解各營業(yè)單位物流成本中存在的問題，以加強(qiáng)管理。按顧客計(jì)算物流成本的方法，又可分按標(biāo)準(zhǔn)單價(jià)計(jì)算和按實(shí)際單價(jià)計(jì)算兩種計(jì)算方式。按顧客計(jì)算物流成本，可用來作為選定顧客、確定物流服務(wù)水平等指定顧客戰(zhàn)略的參考。按商品計(jì)算物流成本是指通過把按功能計(jì)算出來的物流費(fèi)用，用以各自不同的基準(zhǔn)分配給各類商品的辦法計(jì)算物流成本。這種方法可以用來分析各類商品的盈虧，在實(shí)際應(yīng)用時(shí)，要考慮進(jìn)貨和出貨差額的毛收入與商品周轉(zhuǎn)率的影響。